UEB

CARTERA DE SERVEIS

Assessorament estadístic i metodològic d'estudis de recerca clínica i dades d'alt rendiment

       Assessorament i el·laboració de projectes de recerca

        Disseny de l'estudi

        Estimació de mida de la mostra

        Definició de les variables

        Protocols i formularis de recollida de dades

        Preparació de formats per estudis de dades d'alt rendiment

Anàlisi de dades d'estudis de recerca clínica

        Execució i anàlisi de l'estudi

        Disseny de la base de dades

        Validació d'instruments de mesura

        Pla d'anàlisi estadística

        Anàlisi descriptiva de les dades

        Anàlisi de relacions i ajust de models

Anàlisi de dades d'alt rendiment

       Anàlisi de dades de microarrays

        Anàlisi de dades d'RTqPCR (targetes microfluïdiques)

        Anàlisi de variants en exomes

        Estudis de metagenòmica/metabarcoding

        Anàlisi de dades d'RNA-seq

        Altres estudis d'ultraseqüenciació

            Anàlisi de dades de metilació

            Seqüenciació de novo

Anàlisi de dades avançat

        Anàlisi integratiu de dades 'òmiques

        Sel·lecció i validació de biomarcadors

Comunicació de resultats científics

        Elaboració de taules i gràfics

        Redacció dels mètodes d'anàlisi

        Interpretació dels resultats

        Revisió de l'estadística d'una publicació o ponència

        Resposta als comentaris del revisor

Desenvolupament i manteniment d'aplicacions bioinformàtiques

        Bases de dades especialitzades, locals o via web

        Aplicacions a mida i interfícies d'usuari

        Instal·lació i manteniment d'aplicacions bioinformàtiques

Lloguer de recursos (programari i maquinari) per estudis de "big data"

Activitats formatives generals i específiques

        Cursos sobre tòpics generals (estadística, bioinformàtica) o específics (anàlisi de dades d'expressió, anàlisi de supervivència)

        Participació en programes de formació reglada al VHIR o a l'entorn VH

EQUIPAMENT

La unitat té el maquinari i el programari apropiat per a la realització de les seves tasques:

Estacions de treball HP amb 2 o 4 processadors i 8 o 16 GiB de memòria RAM que funcionen amb GNU / Linux.

Servidor i cluster d'altes capacitats per processos que requereixen computació intensiva

        - Node principal amb 64 GiB de RAM

        - Diversos nodes secundaris per càlcul en paral·lel

Servidors web per fer accessibles els resultats dels estudis i les eines d'anàlisi desenvolupades per la UEB

Eines estadístiques i bioinformàtiques diverses com ara:

        - Programari estadístic: R, Stata, SAS, PASS

Eines d'anàlisi de dades:

        - lliures/de codi obert (Bioconductor, GenePattern, Qiime, DAVID...)

        - o de programari de codi tancat (Ingenuity Pathways, CLC Genomics Workbench)

Eines de desenvolupament: MySQL, PHP, Perl, Python, Java