UEB

CARTERA DE SERVICIOS

Asesoramiento estadístico y metodológico de estudios de investigación clínica y datos de alto rendimiento

        Asesoramiento y elaboración de proyectos de investigación

        Diseño del estudio

        Tamaño de la muestra

        Definición de las variables

        Protocolos y formularios de recogida de datos

        Preparación de datos para estudios de datos de alto rendimiento

Análisis de datos de estudios de investigación clínica

        Ejecución y análisis del estudio

        Diseño de la base de datos

        Validación de instrumentos de medida

        Plan de análisis estadístico

        Análisis descriptivo de los datos

        Análisis de relaciones y ajuste de modelos

Análisis de datos de alto rendimiento

        Análisis de datos de microarrays

        Análisis de datos d'RTqPCR (tarjetas microfluídicas)

        Análisis de variantes en exomas

        Estudios de metagenómica/metabarcoding

        Análisis de datos d'RNA-seq

        Otros estudios de ultrasecuenciación

            - Análisis de datos de metilación

            - Secuenciación de novo

Análisis de datos avanzado

        Análisis integrativo de datos 'ómicos

        Selección y validación de biomarcadores

Comunicación de resultados científicos

        Elaboración de tablas y gráficos

        Redacción de los métodos de análisis

        Interpretación de los resultados

        Revisión de la estadística de una publicación o ponencia

        Respuesta a los comentarios del revisor

Desarrollo y mantenimiento de aplicaciones bioinformáticas

        Bases de datos especializadas, locales o vía web

        Aplicaciones a medida e interfaces de usuario

        Instalación y mantenimiento de aplicaciones bioinformáticas

Alquiler de recursos (software y maquinaria) para estudios de "big data"

Actividades formativas generales y específicas

        Cursos sobre tópicos generales (estadística, bioinformática) o específicos (Análisis de datos de expresión, análisis de supervivencia)

        Participación en programas de formación reglada al VHIR o en el entorno VH

EQUIPAMIENTO

La unidad tiene la maquinaria y el software apropiado para la realización de sus tareas:

Estaciones de trabajo HP con 2 o 4 procesadores y 8 o 16 GiB de memoria RAM que funcionan con GNU / Linux.

Servidor y cluster de altas capacidades para procesos que requieren computación intensiva.

        - Nodo principal con 64 GiB de RAM

        - Diversos nodos secundarios para cálculo en paralelo

Servidores web para hacer accesibles los resultados de los estudios y las herramientas de análisis desarrolladas por la UEB

Herramientas estadísticas y bioinformáticas varias como:

        - Software estadístico: R, Stata, SAS, PASS

Herramientas de análisis de datos:

        - libres/de codigo abierto (Bioconductor, GenePattern, Qiime, DAVID...)

        - o de software de codigo cerrado (Ingenuity Pathways, CLC Genomics Workbench)

Herramientas de desarrollo: MySQL, PHP, Perl, Python, Java